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环状RNA hsa_circ_0003568通过miR-140-3p及miR-502-5p调控靶基因CDK6及NFYA在骨肉瘤中的作用

李康路  黄汉记  严国华  谭曼利  黄大计  朱博  
【摘要】:目的 探讨环状RNA hsa_circ_0003568在骨肉瘤(OS)中的表达并采用生物信息学方法进行circRNA-miRNAmRNA的网络构建,分析其可能的机制及临床意义。方法 采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测hsa_circ_0003568在OS细胞系及正常成骨细胞中的表达。随后,基于circRNA-miRNA和miRNA-mRNA构建circRNA-miRNA-mRNA网络。通过多种circRNA软件数据库进行分析hsa_circ_0003568靶向的miRNA,并进一步通过miRNA数据软件预测其靶基因,选择至少4个以上软件支持的靶向miRNA及靶基因,并通过GEPIA数据库软件对靶基因进行生存分析筛选出显著预后差异的靶基因从而分析hsa_circ_0003568潜在的临床意义。结果 RT-qPCR检测结果表明:与正常对照组相比,hsa_circ_0003568在OS细胞系中显著升高(P 0.05)。测序发现hsa_circ_0003568的成环连接点位于IST1前体RNA的第5和6外显子上。生物信息学分析结果显示:hsa_circ_0003568同时靶向两个miRNA(miR-140-3p及miR-502-5p),构建了hsa_circ_0003568、miR-140-3p/miR-502-5p及13个靶基因的circRNA-miRNA-mRNA网络,此外,GEPIA数据库分析中发现CDK6和NFYA两个靶基因,与OS患者的生存预后显著相关(P 0.05),并且NFYA同时是miR-140-3p及miR-502-5p的潜在靶基因。结论 高表达的hsa_circ_0003568可能通过miR-140-3p及miR-502-5p调控基因CDK6及NFYA参与OS的发生发展过程。

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